O Projeto de Educação para a Saúde (PES) nas escolas, sob as orientações da Direção Geral da Educação e em conjunto com a equipa de saúde escolar e de vários parceiros, visa dotar as crianças e os jovens de conhecimentos, atitudes e valores que os ajudem a fazer opções e a tomar decisões adequadas à sua saúde e ao seu bem-estar físico, social e mental, bem como a saúde dos que os rodeiam.
O PES desenvolve a sua actividade com base no Referencial de Educação para a Saúde nas seguintes áreas temáticas: